L’arrivée du chemin de fer le 30 août 1880 va modifier les habitudes de déplacement de la population – d’abord réticente mais rapidement conquise – et permettre le développement rapide du commerce et, plus tard, du tourisme.
Carte de l’époque de l’ouverture de la ligne : la nouvelle gare est dans le cercle rouge. Aucune route n’y aboutit. Seule la route nationale (future D903) traverse le secteur. Les villages ne sont desservis que par des chemins.
En 1880, lorsque le train est arrivé à la gare de Perrignier, il a fallu créer et consolider un réseau de routes carrossables ; c’est à cette époque qu’a été aménagé le chemin de Cervens à l’Oratoire, prolongé ensuite jusqu’à la gare. Cervens ne se trouvait qu’à 2,5 km du rail, on allait à pied à la gare en 30 minutes : à cette époque, la marche à pied était la règle et on marchait vite !
La gare de Perrignier en 1960. Le chef de gare, dans sa tenue réglementaire, n’existe plus, la halle à marchandises a disparu au profit d’un parking.
L’électrification ne sera réalisée qu’en 1972.
C’est de la gare de Perrignier que partirent les hommes mobilisés le 2 août 1914 ; c’est là aussi que les non-mobilisés ont mené, la mort dans l’âme, les chevaux et le bétail réquisitionnés par l’Armée quelques jours plus tard, laissant les moissons inachevées.
La gare de Perrignier est la gare la plus proche d’Habère-Poche et du haut de la Vallée Verte : le café Peillex et le café Bossus ont vu s’arrêter un grand nombre de Dhabérants qui s’y rendaient à pied en passant par le Col de Cou et Cervens. Irène Peillex (1916-1992), ultime épicière du chef-lieu se souvient de son enfance : « Notre café faisait aussi fonction de restaurant et parfois d’hôtel où les voyageurs arrivés au dernier train et qui ne voulaient pas monter à Habère-Poche la nuit pouvaient dormir. Au cours d’un hiver particulièrement rigoureux, un homme arrivé au dernier train du soir n’a pas voulu rester dormir, il est parti seul dans la nuit et la neige dans la montée du Col de Cou, s’est perdu… On a retrouvé son cadavre à la fonte des neiges. »
Aujourd’hui, la gare est toujours là. Le trafic local des marchandises a disparu depuis les années 1980 ; le personnel de la gare a lui aussi disparu. Le CEVA, acronyme de Cornavin – Eaux-Vives – Annemasse, dont le projet a mis plus de 100 ans à aboutir ( ! ) a été mis en service en 2019. Il est devenu le Léman Express.
La gare en 2026. Le CEVA lui a redonné une affluence qu’elle n’avait plus connu depuis longtemps.